پیپٹائڈس کو اپنی مرضی کے مطابق بنائیں

بڑے پیمانے پر کسٹم پیپٹائڈ ترکیب کو مائع حل میں یا ٹھوس مرحلے میں بھی انجام دیا جاسکتا ہے۔ عام طور پر ، پیپٹائڈس سے کم 8 امینو ایسڈ حل کیمسٹری کے ذریعہ زیادہ معاشی طور پر تیار ہوتے ہیں۔ پیپٹائڈس 8 سے زیادہ اوشیشوں کو عام طور پر ٹھوس مرحلے کی کیمسٹری کے ذریعہ جمع کیا جاتا ہے۔ ٹھوس فیز پیپٹائڈ ترکیب (ایس پی پی ایس) کو یا تو دستی طور پر یا مکمل طور پر خودکار انداز میں انجام دیا جاسکتا ہے۔ مختصر پیپٹائڈس کے لئے دستی ترکیب فائدہ مند ہے کیونکہ یہ اسکیلنگ کے وقت زیادہ لچک کی اجازت دیتا ہے اور یہ زیادہ آسانی کے ساتھ غیر متوقع مسائل کو خرابیوں کا سراغ لگانے کی اجازت دیتا ہے۔ مثال کے طور پر ، بجلی کی ناکامی یا آلے ​​کی ناکامی کی صورت میں ، آپریٹر ڈپریٹیکشن کے دوران پائپریڈائن کو دھو سکتا ہے۔ مزید برآں ، تھرموڈینیٹک اختلاط کو دستی نقطہ نظر کے ساتھ بہتر طور پر کنٹرول کیا جاسکتا ہے۔ دوسری طرف ، بڑے پیمانے پر مکمل طور پر خود کار طریقے سے پیپٹائڈ ترکیب کے آلات کو غیر منظم آپریشن اور ترکیب رن کی وسیع دستاویزات کا واضح فائدہ ہے۔ لہذا ، خودکار پیپٹائڈ ترکیب کو عام طور پر وسط پیمانے کی حد میں لمبے پیپٹائڈس کی ترکیب کے لئے بہترین انتخاب کے طور پر منتخب کیا جاتا ہے۔

پیپٹائڈ ترکیب فراہم کرنے والوں کو معیار کی سطح اور ترکیب شدہ پیپٹائڈس کی زیادہ سے زیادہ لمبائی کے ذریعہ ماپا جاتا ہے کیونکہ اعلی معیار پر لمبے پیپٹائڈس کی ترکیب کرنا زیادہ مشکل ہے۔ ترکیب شدہ پیپٹائڈس کو تجزیاتی HPLC اور بڑے پیمانے پر اسپیکٹومیٹری کے ذریعہ QC کے طریقہ کار سے گزرنا چاہئے۔ اکثر ، امینو ایسڈ تجزیہ اور ترتیب کی بھی ضرورت ہوتی ہے۔

حیاتیاتی طور پر فعال پیپٹائڈس کو بڑھتی ہوئی تعداد میں فعال دواسازی کے اجزاء (API's) کے ساتھ ساتھ اسٹینڈ اسٹون مصنوعات جیسے واسوپریسین ، گوناڈوریلین ، لیو پرولائڈ ، اور گوسیرلن میں ضم کیا گیا ہے۔ انسانی جینوم پروجیکٹ کی تکمیل کے نتیجے میں تقریبا 30 30 ، 000 پروٹین کی نشاندہی ہوئی جس میں انسانی جینوم میں انکوڈ کیا گیا تھا اور بائیو میڈیکل محققین کو دریافت کرنے کے لئے اور بھی بہت سے نئے ہدف کے انو فراہم کیے گئے ہیں۔ عقلی ڈیزائن کے نقطہ نظر کا استعمال کرتے ہوئے دیئے گئے پیپٹائڈ یا پروٹین کی آبائی قوت میں اضافے کے امکان کی تحقیقات کے ل ، ، چھوٹی اور بڑی مقدار میں پیپٹائڈس کی ضرورت ہے ، کچھ ملیگرام اسکیل میں۔ ایک بار جب مطلوبہ سرگرمی یا قوت کی نشاندہی ہوجائے تو ، بڑے پیمانے پر ترکیب کی ضرورت ہوتی ہے۔ اس کے لئے ، جانوروں کے چھوٹے چھوٹے مطالعے کو شروع کرنے کے لئے گرام سے ملٹی گرام اسکیل کی ضرورت ہوسکتی ہے۔ اکثر ، کامیاب توثیق کے بعد ، ترکیب کے ایک اور بھی بڑے پیمانے پر مطلوبہ ہوسکتا ہے۔ یہ سیکڑوں گرام سے ملٹی کلو مقدار تک پیمانے پر ہوسکتے ہیں۔

تھرو پٹ اور متوازی ترکیب کا سوال
مختلف ایپلی کیشنز اور تحقیق کے مراحل میں پیپٹائڈس کی مختلف تعداد کی ترکیب کی ضرورت ہوتی ہے۔ پیپٹائڈ ڈرگ ڈسکوری پروگرام میں کامیابیاں تلاش کرنے کے لئے سیکڑوں (یا یہاں تک کہ ہزاروں) پیپٹائڈس کی اسکریننگ شامل ہوسکتی ہے ، اس کے بعد کسی ایک امیدوار کی نشاندہی کرنے کے لئے فوکسڈ لائبریریوں کے ساتھ ڈھانچے کی سرگرمی کے تعلقات (SAR) کو بہتر بنایا جاسکتا ہے جو کلینک میں ترقی یافتہ ہوسکتا ہے۔ کامیابی کی کلید لہذا یہ ہے کہ ایک ترکیب ساز کا انتخاب کریں جس میں کافی رد عمل والے برتن ہوں جو متوازی ترکیب کی سطح کو فراہم کرسکیں جو آپ کو اپنی ایپلی کیشن 1 سے ملنے کی ضرورت ہے۔
 

ترکیب اسکیل
آر اینڈ ڈی عمل کے مختلف مراحل میں پیپٹائڈ مواد کی مختلف مقدار میں بھی ضرورت ہوگی۔ مثال کے طور پر ، مقدار میں اضافے کی ضرورت ہے کیونکہ پیپٹائڈ کے علاج معالجے کی ابتدائی اسکریننگ کے ذریعے آپٹیمائزیشن اور پری کلینیکل ترقی کی رہنمائی کی جاتی ہے۔ دائیں پیپٹائڈ سنتھیزائزر پیمانے کی موجودہ ضروریات کو پورا کرے گا اور تقاضوں کو مزید لائن میں مزید میچ کرنے کے لئے پیمانے کے ل some کچھ لچک پیش کرسکتا ہے۔
 

ترتیب مشکل اور پیپٹائڈ کی لمبائی
پیپٹائڈس کی ترکیب سازی بہت سے تسلسل پر مبنی چیلنجز پیش کرسکتی ہے ، جیسے کچھ اوشیشوں کے امتزاج کی وجہ سے جمع یا ثانوی ڈھانچے کی تشکیل۔ ان چیلنجوں پر قابو پانے میں ایک پیپٹائڈ سنتھیزائزر کا انتخاب کرنا شامل ہے جو آپ کو ترکیب کو بہتر بنانے میں مدد فراہم کرسکتا ہے۔ اعلی ترین طہارت کی تلاش میں بہت سارے پیرامیٹرز کو بہتر بنانا شامل ہے ، جیسے رد عمل کے اوقات ، جوڑے کے ریجنٹ کا انتخاب ، حراستی ، رال کی قسم ، درجہ حرارت ، اور ساخت توڑنے والی باقیات کی جگہ کا تعین کرنا۔ متوازی طور پر مختلف پیرامیٹرز کی جانچ کے لئے ملٹی چینل آلات مثالی ہیں۔ مشکل پیپٹائڈس کی ترکیب کرتے وقت آزمائشی اور غلطی کو کم سے کم کرنے کا ایک طریقہ یہ ہے کہ فضلہ کے دھارے کی نگرانی کے بجائے ریئل ٹائم یووی مانیٹرنگ کا استعمال جیسا کہ زیادہ تر تجارتی طور پر دستیاب آلات کرتے ہیں۔ ترکیب ساز جو رد عمل کے حل کی نگرانی کرتے ہیں جب کہ یہ اختلاط کر رہا ہے تو رد عمل کے اوقات کو عملی طور پر کنٹرول فراہم کرتا ہے ، جس سے پیداوار اور طہارت کو بہت بہتر بنایا جاتا ہے۔ اگر آپ لمبے پیپٹائڈس کی ترکیب کر رہے ہیں تو پھر یہ بہت ضروری ہے کہ ہر قدم پر رد عمل کی کارکردگی کو زیادہ سے زیادہ کیا جاتا ہے ، کیونکہ یہاں تک کہ چھوٹی چھوٹی نااہلیوں اور ضمنی رد عمل سے پاکیزگی اور پیداوار کو ڈرامائی طور پر کم کرنے میں اضافہ ہوگا۔ ترکیب کی کارکردگی کو بہتر بنانے کے ل some ، کچھ آلات میں ایک فلوڈک سسٹم ہوتا ہے جو صفر مردہ حجم کو یقینی بناتا ہے اور رد عمل کے مراحل کے مابین کوئی متضاد نہیں ہوتا ہے ، جو ٹھوس مرحلے کے پیپٹائڈ ترکیب کے اضافے ، حذفوں اور دیگر عام ضمنی رد عمل کو کم کرتا ہے۔
 

خصوصی کیمسٹری کی ضرورت
کیا آپ صرف معیاری لکیری پیپٹائڈس کی ترکیب کریں گے ، یا آپ چکرو پیپٹائڈس ، پیپٹائڈز یا دیگر پیپٹائڈومیومیٹکس بنا رہے ہوں گے؟ کیا آپ پی این اے ، پی ایم او ایس ، یا اولیگوس کے ساتھ کام کریں گے؟ چکرو پیپٹائڈس کی ترکیب میں اکثر خاص طور پر محفوظ امینو ایسڈ مشتق اور آرتھوگونل ڈپارٹیکشن اور چکر لگانے کے لئے رد عمل کے اقدامات کا استعمال شامل ہوتا ہے۔ پیپٹائڈز اور پیپٹائڈومیومیٹکس کی دیگر اقسام کی ترکیب ، نیز پی این اے ، اولیگوس ، اور اولیگومیومیٹکس سب کو انفرادی monomers اور regents کی ضرورت ہوتی ہے۔ اس قسم کے انووں کی تیاری ایک ایسے آلے کا مطالبہ کرے گی جو پروٹوکول اور بوتل کی پوزیشنوں کے لحاظ سے زیادہ سے زیادہ لچک پیش کرے۔ یہی وجہ ہے کہ کچھ آلات قدرتی امینو ایسڈ کے لئے 20 پوزیشنوں تک محدود رہنے کی بجائے ترکیب کے دوران 40 امینو ایسڈ یا دوسرے مونومرز تک استعمال کرتے ہیں۔ ان خصوصی کیمسٹریوں کے لئے استعمال ہونے والے بہت سے مونومرز اور ریجنٹس مہنگے یا قیمتی ہوسکتے ہیں ، لہذا کچھ ترکیب ساز بھی کسی بھی امینو ایسڈ/مونومر بوتل کی پوزیشن سے پرائم فری فری 'سنگل شاٹ' کے اضافے کی پیش کش کرتے ہیں تاکہ یہ یقینی بنایا جاسکے کہ کچھ بھی ضائع نہیں ہوا ہے۔